分居是指婚姻关系中的一方提出离开婚姻共同生活的情况，通常是由于夫妻之间发生了无法解决的矛盾或冲突。而外遇是指一方在婚姻关系中与第三者发生了婚外情。在一些国家的法律中，夫妻之间发生外遇可以成为诉求离婚的理由之一，并且可以作为判决离婚的依据。那么，是否可以将夫妻分居作为对有外遇行为的配偶进行处罚的依据呢？

首先，需要明确一点的是，分居并不等同于离婚。分居只是夫妻关系的一种处理方式，并不意味着婚姻的终结。夫妻分居是一种暂时的解决办法，就是为了给夫妻双方一个冷静思考的时间和空间，以便找出问题所在并寻求解决之道。因此，只有在婚姻关系确实无法挽回的情况下，才会进一步走向离婚。而夫妻是否能够和好如初、平复伤痛，分居也未必能够起到决定性的作用。

其次，分居并不是合法的刑事罪行。在刑法中，对于夫妻之间发生的婚外情并没有明确的刑事处罚措施。因为婚外情属于私人关系范畴，法律通常不会对此进行干涉，除非对方的行为构成其他违法行为（如性侵犯、恶意诽谤等）。因此，将分居作为判罪依据并不符合法律常识和常规。

然而，在某些特殊情况下，分居可能会影响离婚案件的审理结果。在离婚案件中，夫妻之间存在分居事实可能会成为离婚案件中的一个关键证据。在一些国家的离婚法中，外遇行为可能匹配不忠或不贞的定义，以此作为分析纠纷主要责任的标准。一旦配偶对夫妻关系的负责度以及是否违反法律或道德义务造成了伤害，可能会对法庭做出离婚或分配财产等决策产生一定影响。

此外，分居也可能影响夫妻关系中的经济权益。在离婚案件中，家庭财产的分割是一个需要考虑的重要问题。在某些国家中，夫妻长期分居并且经济上独立的状况下，对方可能可以主张分得比受罪较多的财产，或者获得更多的抚养费和赡养费。这是因为夫妻分居后，一方可能失去了原本共同生活所享有的财产权益和经济支持，因此法院在判决财产分割的时候会考虑这一点，以保障分居方的权益。

综上所述，分居并不能直接作为对有外遇行为的配偶进行判罪的依据。然而，在离婚案件中，分居可能会成为离婚的理由之一，并影响法庭的判决结果。此外，分居也可能影响财产分割和经济权益的判决。因此，夫妻之间的分居可以起到一定的作用，但并不等同于对有外遇行为的配偶的判罪。